上海交通大學馬克思主義學院于2009年6月19日正式成立。馬克思主義學院是以原人文學院思想政治理論教育中心為主體組建的，為直屬學校領導的思想政治理論課教學科研二級機構。學院現有教職工35人，其中教授8名，副教授16名。
馬克思主義學院是學校思想政治理論課教學部門和馬克思主義理論研究機構，也是馬克思主義理論學科點的依托單位。目前，學院下設“六室一所”，負責全校本科生、研究生思想政治理論課的教學、研究和管理，主管研究生的培養及馬克思主義理論研究等工作。承擔全校本科生《馬克思主義基本原理概論》、《毛澤東思想與中國特色社會主義理論體系概論》、《中國近現代史綱要》、《思想道德修養與法律基礎》、《形勢與政策》以及研究生思想政治理論課的教學工作，并承擔馬克思主義理論學科建設。
學院高度重視思想政治理論課教學工作，大力推進思想政治理論課改革，不斷創新手段和方法，取得了較為突出的成績，在學校思想政治教育中發揮了主渠道、主課堂作用。馬克思主義學院將在學校黨委和相關部門領導的指導和支持下，在提升學院的學術競爭力、社會影響力和國際化水平過程中，不斷實現新的跨越。