2002年審批的國家重點學科（9個）：
計算數學、等離子體物理、工程力學、機械制造及其自動化、水工結構工程、港口、海岸及近海工程、應用化學、船舶與海洋結構物設計制造、管理科學與工程 。
2007年審批的一級國家重點學科4個、二級國家重點學科6個。4個一級重點學科共覆蓋15個二級重點學科、加上6個未被覆蓋二級重點學科、至此函蓋的二級國家重點學科數達到21個。
一級學科國家重點學科：
力學
水利工程
化學工程與技術
管理科學與工程
二級學科國家重點學科（包括一級覆蓋的二級學科）：
計算數學
等離子體物理
一般力學與力學基礎
固體力學
流體力學
工程力學
機械制造及其自動化
結構工程
水文學及水資源
水力學及河流力學
水工結構工程
水利水電工程
港口、海岸及近海工程
化學工程
化學工藝
生物化工
應用化學
工業催化
船舶與海洋結構物設計制造
環境工程
管理科學與工程
17個一級學科遼寧省重點學科（覆蓋59個二級學科）：
數學、化學、力學、光學工程、機械工程、材料科學與工程、化學工程與技術、動力工程及工程熱物理、生物醫學工程、
土木工程、水利工程、儀器科學與技術、信息與通信工程、計算機科學與技術、環境科學與工程、管理科學與工程、工商管理。
10個二級學科遼寧省重點學科：
科學技術哲學、產業經濟學、等離子體物理、理論物理、建筑設計及其理論、電機與電器、控制理論與控制工程、船舶與海洋結構物設計制造、思想政治教育、教育經濟與管理。