北京理工大學研究生教育始于1953年，1978年恢復研究生教育，1981年被國務院批準為全國首批具有博士、碩士學位授權的單位之一，1984年被國務院批準為全國首批22所試辦研究生院的大學之一。
北京理工大學研究生院設有綜合管理辦公室、培養辦公室、學科建設與學位辦公室和研究生工作部，
北京理工大學研究生院院長負責全校學科建設、研究生招生、培養、學位授予、研究生德育和管理、博士后及訪問學者接收與管理工作。研究生院不斷探索“以學生為本”、全面提高培養質量的研究生教育制度，經過多年的努力，已形成一整套系統、科學、規范的管理制度與運行機制，在1999年12月，被教育部和國務院學位委員會評為全國學位與研究生教育管理先進集體。
目前，北京理工大學已形成了“以工為主、工理文協調發展”的多學科研究生教育體系，已成為我國高層次人才培養的主要基地之一。現在學校學科涉及10個學科門類，有19個博士學位授權一級學科點，61個博士學位授權點，144個碩士學位授權點，MBA/EMBA和工程碩士(包括16個工程領域)2個專業學位授權點;有11個國家重點學科，25個部級重點學科;17個博士后流動站，1個國家重點實驗室，2個國防科技重點實驗室，4個國家重點學科點專業實驗室。有15名中國科學院和中國工程院院士，320名博士研究生指導教師。